1、改良土壤、培肥地力。有機肥料施入土壤后，有機質能有效地改善土壤理化狀況和生物特性，熟化土壤，增強土壤的保肥供肥能力和緩沖能力，為作物的生長制造良好的土壤條件。
2.增加產量、提高品質。有機肥料含有豐富的有機物和各種營養元素，為農作物提供營養。有機肥腐解后，為土壤微生物活動提供能量和養料，促進微生物活動，加速有機質分解，產生的活性物質等能促進作物的生長和提高農產品的品質。
3.提高肥料的利用率。有機肥含有養分多但相對含量低，釋放緩慢，而化肥單位養分含量高，成份少，釋放快。兩者合理配合施用，相互補充，有機質分解產生的有機酸還能促進土壤和化肥中礦質養分的溶解。有機肥與化肥相互促進，有利于作物吸收，提高肥料的利用率。
我國目前農田施肥投入的總養分量中約有1/4以上的氮、1/3以上的磷、80%以上的鉀、90%以上的微量元素靠施有機肥解決，施用有機肥是現代農業持續發展的重要基礎。大量的研究和實踐認為，有機肥養分全面，肥效持久。有機肥中不僅含有植物必需的大量元素、微量元素，還含有豐富的有機養分，有機肥是最全面的肥料。有機肥能改善土壤理化性狀，提高土壤肥力，可促進土壤微生物的活動。有機肥可就地取才，就地施用，來源廣，成本低，通過增施有機肥不僅可以增加養分，提高地力，提高化肥的利用率，相應地也降低了化肥的用量，從而降低了施肥成本，是農業節本增效的重要措施之一。
有機肥的施用，在指導思想上應強調與化肥并重，二者配合施用，做到互為補充，實現結構合理、供需平衡；在施用方法上主要用作底肥，結合耕翻全層施用，腐熟好的優質農肥、草木灰也可用作追肥，大力推行作物秸稈直接還田；在肥源上，要充分挖掘利用人糞尿、畜禽糞尿、作物秸稈、雜草、落葉及一切農業生產的廢棄物，充分利用草木灰、土雜肥、餅肥，因地制宜擴大綠肥種植面積。
有機肥與化肥配合施用是我國肥料工作的長期方針，其意義在于能提高作物產量，改善農田生態環境，提高經濟效益。其好處主要體現在以下諸方面：１．有機肥含有作物所需的各種營養元素和某些生物活性物質，而化肥所含養分除復合肥外，較單一。有機肥與化肥所含養分、種類各不相同，配合施用能長短互補。２．有機肥肥效慢而穩，當季利用率低，但后效長；化肥多為速效肥，易被作物及時吸收，肥效快，但不持久。兩者配合施用，可相互彌補不足。３．有機肥與化肥配合施用，化肥中的無機氮可提高有機氮的礦化率，有機氮能提高無機氮的生物固定率。增施有機肥在于養地，增施化肥在于用地，兩者配合有利于作物高產與穩產。??
